Даффи – воспитанник Эвертона, который начал заниматься вместе с первой командой в 16-летнем возрасте. Дебютировал сразу же в еврокубках в 2009 году.

Шейн подавал большие надежды, но все сломала травма, которую он получил в матче за сборную. Долгий простой не способствовал профессиональному росту.

Лишь в 2012 году после недолгой аренды в Сканторп Даффи дебютировал в АПЛ, проведя четыре матча.

Теперь 22-летний ирландец будет выступать в Блэкберне. Сумм трансфера не называется, но известно, что его контракт с Бродягами рассчитан на ближайшие три сезона.