В полуфинальном матче Евро-2016 Германия – Франция (0:2) Боатенг был заменен из-за травмы бедра.

Сам защитник выразил сомнение, что успеет восстановиться до начала сезона. Однако клуб выступил с противоположным заявлением. В нем говорится, что "тщательное обследование после возвращения Жерома в Мюнхен" показало, что он будет готов играть.

Бавария откроет сезон 14 августа матчем за Суперкубок Германии против дортмундской Боруссии, 19 августа ей предстоит игра против Карл Цайсса из Йены в Кубке Германии, а 26-го – домашний матч с Вердером в чемпионате.