Виери дебютировал в Серии А в 1991 году в составе "Торино". Однако наибольшую известность приобрел, будучи игроком миланского "Интера", куда перешел в 1999 году из "Лацио" за 49 млн. долларов - рекорд на трансферном рынке в то время.

В составе "Интера" провел 143 матча, в которых забил 102 мяча. В прошлом сезоне защищал цвета французского "Монако", но, проведя в его составе лишь семь матчей, получил тяжелую травму, которая перечеркнула его надежды сыграть на ЧМ-2006.